Sillamäe Gümnaasiumi juhtimisskeem on lihtne. Põhiprotsess on õpe ja kasvatus, mida juhib õppealajuhataja. Toetavad protsessid ja vastavad struktuurid on noorsootöö ja projektitegevuse allstruktuuriüksus, mida juhib koolielu korraldaja ning arendus ja - haldusstruktuuriüksus, mida juhib heaoluspetsialist. Koolijuhi vahetus alluvuses on personalispetsialist ja juhiabi.
Gümnaasiumis on õppetegevuse ja koostöö paremaks korraldamiseks moodustatud õpetajate aineühendused ja teemavaldkondades juhivad koostööd ja lõimingut koordinaatorid.
Erinevate projektide elluviimiseks moodustatakse projektimeeskonnad. Õpetajatevahelist koostööd toetavad koostööajad ja õpiringid.
Avaldatud 10.05.2022.
Viimati muudetud 07.09.2025.